El Cortejo Procesional del Miércoles Santo es responsabilidad de la Diputación Mayor de Gobierno de la Hermandad y es aprobado por la Junta de Gobierno cada año. El cortejo procesional para el Miércoles Santo 2027 es el siguiente:
Tramo de Misterio
Sector 1.º – Cruz de Guía.
Sector 2.º – Senatus.
Sector 3.º – Estandarte de San Francisco.
Sector 4.º – Bandera Pontificia.
Sector 5.º – Bandera de Hermandad.
Sector 6.º – Antepresidencias, Presidencias y Acólitos.
Sector 7.º – Paso de Misterio
Tramo de Palio
Sector 1º – Cruz Conventual.
Sector 2º – Guion de Juventud.
Sector 3º – Reliquia de Fray Leopoldo de Alpandeire.
Sector 4º – Estandarte de la Purísima Concepción.
Sector 5º – Banderines Fundacionales.
Sector 6º – Guion de Coronación.
Sector 7.º – Simpecado.
Sector 8º – Estandarte de Hermandad (Bacalao), Antepresidencias, Presidencias y Acólitos.
Sector 9º – Paso de Palio.
Sector 10º – Presidencia Civil.